Weitere Arbeitszusammenhänge und langjährige Kooperationen bestehen mit (in alphabetischer Reihenfolge):
Alfred Landecker-Stiftung
Arolsen Archives. International Center on Nazi Persecution
Bildungsstätte Anne Frank e.V., Frankfurt am Main
Bildungswerk Stanislaw Hantz e.V.
Collegium Carolinum, Forschungsinstitut für die Geschichte Tschechiens und der Slowakei
Deutsch-israelische Schulbuchkommission
Deutsches Filminstitut / Deutsches Filmmuseum, Frankfurt am Main
Euro Clio (European Association of History Educators)
Forschungsstelle Antiziganismus am Historischen Seminar der Universität Heidelberg
Forschungsverbund »Normative Ordnungen« an der Goethe-Universität Frankfurt am Main
Frankfurter Historische Kommission
Gedenkstätte Breitenau
Gedenkstätte Hadamar
Georg-Eckert-Institut für internationale Schulbuchforschung in Verbindung mit dem Lehrstuhl für Geschichtsdidaktik der Uni Leipzig
Hannah-Arendt-Institut für Totalitarismusforschung e.V. an der TU Dresden
Hessisches Hauptstaatsarchiv Wiesbaden
Hessische Landeszentrale für politische Bildung; Referat Gedenkstätten, Extremismus, Antisemitismus
Historisches Museum, Frankfurt am Main
Initiative »Nach dem Rechten sehen«
Imre Kertész Kolleg Jena
Jena Center Geschichte des 20. Jahrhunderts
Kommission für die Geschichte der Juden in Hessen
KZ-Gedenkstätten Buchenwald und Mittelbau-Dora
KZ-Gedenkstätte Dachau
Landesarbeitsgemeinschaft (LAG) der Gedenkstätten und Erinnerungsinitiativen zur NS-Zeit in Hessen
Lehrstühle für Neuere und Neueste Geschichte beziehungsweise Zeitgeschichte an den Universitäten Augsburg, Berlin, Freiburg im Breisgau, Hamburg, Jena, Konstanz, Tübingen
Memorium Nürnberger Prozesse
Redaktion der »Beiträge zur Geschichte des Nationalsozialismus«
Ricarda-Huch-Schule
Schulmuseum Nürnberg
Stadt Dachau und Max Mannheimer Haus. Studienzentrum und Internationales Jugendgästehaus Dachau
Stiftung Europäische Jugendbildungs- und Jugendbegegnungsstätte Weimar
Stiftung Topographie des Terrors, Berlin
Studienseminar Frankfurt (Lehrkräfte im Vorbereitungsdienst)
Verband Hessischer Geschichtslehrerinnen und -lehrer
Verein Lernort Zivilcourage & Widerstand e.V. Projekt Lernort Kislau
Visual History of the Holocaust (EU-Horizon 2020 Projekt)
Wissenschaftliche Arbeitsgemeinschaft des Leo Baeck Instituts
Zentrale Stelle für Provenienzforschung in Hessen
Zentrum für Antisemitismusforschung, TU Berlin
Zentrum für Holocaust-Studien am Institut für Zeitgeschichte München-Berlin
Auf internationaler Ebene kooperiert das Fritz Bauer Institut kontinuierlich mit folgenden Institutionen (in alphabetischer Reihenfolge):
Anne Frank Fonds, Basel
Conference on Jewish Material Claims Against Germany, New York und Frankfurt am Main
Deutsches Historisches Institut Moskau
Institut für Zeitgeschichte der Universität Wien
Lehrstuhl für Deutsche und Österreichische Studien, Institut für Internationale Studien, Fakultät für Sozialwissenschaften, Karls-Universität Prag/Tschechien
Leo Baeck Institute – New York | Berlin
Minerva Institute for German History and Wiener Library, Tel Aviv University
Państwowe Muzeum Oświęcim-Brzezinka, Oświęcim
Richard Koebner Minerva Center for German History, Hebrew University Jerusalem
United States Holocaust Memorial Museum, Washington D.C.
The University of Southern California, the Shoah Foundation Institute for Visual History and Education
Wiener Wiesenthal Institut für Holocaust-Studien
Yad Vashem, Jerusalem
Yale University in New Haven, Yale University Library
Fritz Bauer Institut
An-Institut der Goethe-Universität Frankfurt am Main Norbert-Wollheim-Platz 1 60323 Frankfurt am Main